三十八年（1773年），乌鲁木齐同知改为迪化州知州，改乌鲁木齐参赞大臣为乌鲁木齐都统；陕甘总督奏准将马里坤道移驻迪化州巩宁城（在今新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市西北部，也称老满城）；光绪1十年（1884年）新疆建省，清政府设在新疆的军政管理中心由伊犁转到迪化，迪化成为省会，十一年（1885年），升迪化直隶州为迪化府，增设迪化县与乌鲁木齐同为附郭首县。辖：迪化（今新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市南部）、乌鲁木齐（今新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市北部）、奇台（今新疆维吾尔自治区奇台县）、昌吉（今新疆维吾尔自治区昌吉市）、阜康（今新疆维吾尔自治区阜康市）、绥来（今新疆维吾尔自治区玛纳斯县）共6县。1913年废除。