咸平六年（1003），施州南部溪洞蛮内寇，夔州路转运使丁谓、峡路都监侯延赏、权知施州寇瑊派遣高州义军头目田承进以及施州驻兵讨伐，焚其庐室，生蛮都震慑服罪，于是在施州边界设尖木砦，控扼生蛮。九月，夔州路转运使丁谓奏：施州蛮酋谭仲通等三十余人之前叛去，现已招降，请加职任。上曰：“群蛮妄希恩泽，若姑息太过亦不可也。” 诏悉数安排为军砦将领。

大中祥符三年（1010）三月，知施州侍禁孙诩因擅自加税赋入私库，共计绢二十匹，被削籍为民。 大中祥符五年（1012）闰十月，令施州每月朔望给酒水佳肴犒劳溪洞蛮。 天熺二年（1018）五月，以刘永崇知施州。 三年（1019），以供奉官閤门祇侯张元晋赴施州招捉蛮人，知施州刘永崇为辅，旋罢征蛮。

乾兴元年（1022）顺州蛮田彦晏等寇施州暗利砦，知州任吉坐罢，次年讨降之，于是改暗利砦为宁边砦，因任吉征讨有功复任。 天圣四年（1026）宋仁宗下诏：施州溪洞安远、天赐、保顺、南、顺等羁縻州蛮人去京城入贡道路辽远，自今以后进贡物品就留施州，并就地给予赏赐，愿意入京的没十人中许三两人进京，每三年进贡一次。 施州官员将该诏书刻于石柱并立在仪门下，名《蛮人纳贡物碑》和《皇宋奖谕碑》。 天圣九年（1031）十月，施州溪洞蛮覃言绾寇、向进等永宁砦，下诏天赐州等招抚，但因其彼此为婚姻而包庇援助，数次出边骚扰，直至景佑四年（1037）被施州知州刘允忠诱降，允忠升东头供奉官。

二、宋代中期

康定元年（1040）十一月，增设施州通判一员。

庆历六年（1046），施州宁远寨主、西头供奉官田居用升为东头供奉官，赐银五十两，当时益州进士王皋逃罪窜入溪洞，田居用用自己的银两派遣峒人田承昌诱捕了王皋。皇佑二年（1050）正月，宋仁宗下诏：以后归附宋朝而被授予军官的蛮人死后，其子孙可以世袭守边，仍共计食盐，但衣服三年发放。 嘉佑三年（1058），以施州蛮向永胜所领州为安定州（羁縻州）。

熙宁六年（1073），裁施州永兴砦、而置夷平寨。 元丰三年（1080），裁施州永宁寨，置行廊、安碓二寨。

元祐三年（1088）三月，施州蛮田忠进以圣旨放罪，但仍限百日听经官陈首，依旧住坐，若及一年，能弹压蛮众，不复为过，即次第保奏。至元佑五年（1089）二月，加田忠进检校官。

元祐六年（1091）八月，今后施州清江、建始两县防托人户，每遇轮差在诸寨防托外，其本寨官员将校等如敢輙役，并科违制，罪赦去官不原，许被役人陈告，如合要修城寨，申取转运司指挥。

绍圣三年（1096年），置施州铸钱广积监，至绍兴三十年（1160），因铁矿难得，铸钱量由万缗减为七千。

崇宁年间（1102-1106），施州蛮向文疆叛乱，施州通判恭孙诱降并斩杀之。

三、宋代晚期

嘉熙三年（1239）冬，南宋大将孟珙分兵抵御蒙古，其中命伍智思以千人屯兵施州，最后收复夔州。

淳祐三年（1243）五月，宋理宗下诏施州创建郡城，以及关隘六十多所，且本州将士和忠州戍卒服役三年的，都补传一官。开庆元年（1259），施州知州谢昌元自备缗钱百万、米麦千石修筑郡城，受皇帝嘉奖升官一级。

至元十三年（1276）冬，蒙古军蔡邦光率兵攻施州，会大雪，连夜攻城，杀南宋守将何艮，夺其城。 至元十七年（1280）六月，施州市备、大盘、散毛（散毛土司）等溪洞纳款。 至元十八年（1281），大小盘诸洞蛮叛，元世祖命不老领诸翼蒙古汉军三千余人戍守施州，蛮酋向贵誓用（即卯峒土司始祖）等投降。

至元二十五年（1288），以施州之清江县隶夔路总管府。

至顺三年（1332）正月，夔路忠信寨洞主阿具什用率洞蛮八百余人寇施州。

至正二十二年（1362），明末起义军明玉珍在重庆称帝建大夏，时施州人向绍荣招募乡民授予州城而被任命署理元帅府事，明玉珍屡次招降均被向绍荣拒绝，于是明玉珍派遣吕万户攻打施州城，被向绍荣击败，吕万户被擒，但副元帅谭登、覃川隆（即覃古诸）却私下接受明玉珍招降书，释放了吕万户，并将施州城献给了明玉珍，向绍荣不齿，入溪洞而不知所终。

洪武四年（1371），为施南道宣慰使覃大胜率众归附明朝，于是设施州宣慰司等土官。

洪武十四年（1381）四月，复置施州，隶属于夔州府，下辖建始县。 五月，五溪蛮叛，覃芳诸蛮攻陷施州城，施州知州李才、州同孙用明、州判王杰、吏目李毓秀皆死之。于是江夏侯周德兴率兵讨平，继讨平水尽源通塔坪长官司、散毛土司等溪洞。同年七月，置施州卫。洪武十六年（1382）六月，石柱土司溪洞蛮寇犯施州，被黔江守御官军击退。 洪武二十年（1387），安福蛮夏得忠纠集溪洞攻陷施州城，知州胡士能遇害。

洪武二十三年（1390年）施州诸土司大叛乱被平定，裁撤施州，并入施州卫。

唐代天宝（742-755）年间，领清江、建始两县，有3702户、16444人。

宋代元丰年间户口19840户。

施州介于蛮夷之间，住民不知铁犁牛耕之便利，宋代时，施州通判李周开辟水田数千亩，并买来牛让屯戍的军官耕种，驻军赖此不曾断粮。

唐代时，东至叙州七百六十五里，南至黔州四百八十五里，西至万州六百八十五里，北至夔州五百里。

宋代乾德四年（966）蛮酋珍州刺史田景迁归附纳土，于是酉水河以北之地尽入施州。

其地冬暖夏寒。

捍山，离州城二十里永宁村，三国时吴、蜀分界处，阻深居高，便于捍敌，故名“捍山”。银山，在州东七十余里。禄山，在城南一百五十里，其山多禽兽，足以蛮夷射猎，因此得名。连珠山，州东二里，五峰相连，如贯珠，施州的望山。猿啼山，州东八里，林木深茂，啼猿声韵比诸山最多。都亭山，《后汉书》南蛮传：夷水出西都亭，即此山，《隋书》云后周置亭州，取此山以为名。东门山，在歌罗寨西北五十里，东即夜郎故地，古来夷夏分界入贡之门。州基山，在建始县东三十五里，隋建业州于此。瘦驴山，以黄庭坚诗著名。清江，图经一名夷水，蜀中江水皆浊，唯此独清，故名。麒麟溪，在州西八里药山下。盘龙溪，在州驿北马公泉脚下，昔有盘龙于此。铁沟，以苏子瞻诗著名。

地杂夷落，犹近华风，乡音蛮夷、巴汉相混。山岗多砂石，不通牛犁，伐木少畲。

竹王祠，在东门山，即夜郎侯祠，崇宁年间（1102-1106）宋徽宗赐予“灵惠庙”匾额。磨嵯神庙，供磨嵯大王，在州治南百步，磨嵯山属黔州界山，继高深，洛浦蛮依为巢穴，颇为边患，孟蜀王击破之，及祥符年间（1008-1017）归顺，故老云洛浦蛮犯边，神每以阴兵助官军击破贼，灵迹显著，所在祠之。

据曾公亮著《武经总要》记载，北宋时，施州有羁縻州五个：

1、西高州。原名珍州，田氏世袭，北至尖木砦五日程。至明代设高罗土司。

2、富州。向氏世袭刺史。

3、顺州。

4、奉化州。

5、天赐州。

宋代设军砦十二个，有义军士丁砦将1200余人：

1、宁边砦。旧名暗利，天圣中赐今名，北至州三百里，西至五路溪口八蛮界，约五十里，南至安化州蛮界。

2、连天砦。西至州四百五十里，东南罗大砦、松木隘、曲木隘，入溪洞懿州路，南至蛮界二十里，又三十里至顺州。

3、尖木砦。东北至州二百里，七日程，砦城咸平中置，初，高州蛮人抄掠汉界，乃置砦守之，溪洞贴息。

4、永宁砦。东北至州二百六十里。

5、静边砦。东北至州二百五十里，七日程，南，顺州；西，尖木砦，十五里。

6、施度砦。北至州二百二十五里，西南歌罗砦。

7、永兴砦。南控五路溪口，入天赐州界，控蛮夷五路溪口，北至州二百六十里。

8、歌罗砦。东至施度砦十五里，西南至永宁砦，西北至州二百四十五里。

9、细砂砦。北至州二百八十五里。

10、太平砦。北至州一百三十二里。

11、罗大砦。在建始县界，北至县四百七十三里。

12、支木隘，在建始县界，北至界二百七里。

另据《宋史》记载，施州清江郡清江县有六砦：歌罗、永宁、细沙、宁边、尖木、夷平，熙宁六年（1073）五月裁撤永兴砦、设置夷平砦，元丰三年（1080年）七月废永宁砦，设置行廊砦、安确砦。